El equipo turco, cuartofinalista en la pasada edición de la competición, se incorporará en la segunda fase, que se disputará entre el 29 de julio y el 6 de agosto, y en la que también participará el Rangers escocés, subcampeón en la última Copa de la UEFA, que se medirá al ganador de la eliminatoria previa entre el FBK Kaunas lituano y el Santa Coloma de Andorra. El sorteo realizado en la sede de la UEFA en Nyon (Suiza) y conducido por el secretario general de este organismo, David Taylor, y el responsable de competiciones, Michele Centenaro, deparó también enfrentamientos como el del Sparta de Praga checo con el ganador de la eliminatoria Aktobe (KAZ)-Sheriff (MDA) y el del Panatinaikos griego con el vencedor del Dinamo Tbilisi (GEO)-NSI Runavik (FRO).

La final será en el Olímpico de Roma
Un total de 28 equipos disputarán la primera eliminatoria previa, entre el 15 y el 23 de julio, y los ganadores accederán a la segunda junto a los 14 que se incorporarán directamente a ésta. Entre ellos figuran también el Brann (NOR), el Partizan (SBR), el Rapid de Viena (AUT), el Basel (SUI), el Dinamo de Kiev (UCR), el Anderlecht (BEL), el Beitar Jerusalén (ISR) y el Aalborg (DIN). Los ganadores de la segunda eliminatoria previa pasarán a la tercera, que se sorteará el 1 de agosto y en la que se incorporarán otros 18 clubes, en busca de la fase de grupos. La final de la Liga de Campeones 2008-2009 se jugará en el estadio olímpico de Roma el 27 de mayo del año próximo.

Primera ronda previa
(Ida: 15/16 Jul. Vuelta: 22/23 Jul)

1. Linfield FC (NIR)-NK Dinamo Zagreb (CRO)

2. Valeta FC (MLT)-FC Artmedia Petrzalka (SVK)

3. FC Dinamo Tiflis (GEO)-NSÍ Runavík (FRO)

4. FC Santa Coloma (AND)-FBK Kaunas (LTU)

5. S.S. Murata (SMR)-IFK Göteborg (SUE)

6. Llanelli AFC (WAL)-FK Ventspils (LVA)

7. Anorthosis Famugusta (CYP)-FC Pyunik (ARM)

8. FK Inter Baku (AZE)-FK Rabotnicki (MKD)

9. Tampere United (FIN)-FK Buducnost Podgorica (MNE)

10. F91 Dudelange (LUX)-NK Domzale (SVN)

11. KS Dinamo Tirana (ALB)-FK Modrica (BIH)

12. FK Aktobe (KAZ)-FC Sheriff (MDA)

13. Drogheda United FC (IRL)-FC Levadia Tallinn (EST)

14. FC BATE Borisov (BLR)-Valur Reikiavik (ISL)

Segunda ronda previa
(Ida: 29/30 Jul. Vuelta: 5/6 Ago)

Rangers FC (SCO)-Ganador partido 4

SK Brann (NOR)- Ganador partido 6

Ganador partido 8-FK Partizan (SRB)

Ganador partido 9-Ganador partido 2

Ganador partido 7-SK Rapid Viena (AUT)

Ganador partido 10-Ganador partido 1

Panathinaikos FC (GRE)-Ganador partido 3

Ganador partido 5-FC Basilea 1893 (SUI)

Ganador partido 12-AC Sparta Praga (CZE)

Ganador partido 13-FC Dinamo Kiev (UKR)

RSC Anderlecht (BEL)-Ganador partido 14

Beitar Jerusalén FC (ISR)-Wisla Cracovia (POL)

Fenerbahçe SK (TUR)-MTK Budapest (HUN)

Aalborg BK (DIN)-Ganador partido 11